Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TRIM32Q13049 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TRIM32Q13049 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TRIM32Q13049 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TRIM32Q13049 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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