Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms