Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms