Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAG1P54619 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms