Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A3P48764 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms