Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms