Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms