Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYF6P23409 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYF6P23409 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms