Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms