Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC19A2O60779 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms