Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM6BO15054 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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