Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLDN34H7C241 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN34H7C241 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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