Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3BNH8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BNH8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BNH8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms