Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms