Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms