Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms