Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms