Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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