Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOJQ9H4E5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms