Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms