Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT27Q9BW83 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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