Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FRMD6Q96NE9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms