Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms