Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms