Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNERQ8NFT8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms