Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms