Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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