Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf62Q7Z3J2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms