Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms