Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYW3Q6IPR3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms