Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM46CQ5VWP2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms