Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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