Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLFQ16534 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLFQ16534 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms