Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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