Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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