Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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