Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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BRD3Q15059 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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