Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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