Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SPIDRQ14159 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIDRQ14159 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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