Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms