Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms