Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAAP100Q0VG06 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms