Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms