Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB28P51157 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms