Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms