Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms