Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms