Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALM2P0DP24 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALM2P0DP24 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms