Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRODHO43272 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRODHO43272 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRODHO43272 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms