Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUSKO15146 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUSKO15146 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUSKO15146 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUSKO15146 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUSKO15146 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUSKO15146 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUSKO15146 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUSKO15146 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms